发卡管理系统包括操作人员权限管理、人事管理、卡片管理、通信管理及数据备份与回复等功能模块。发卡本着一人一卡原则。卡片发行后，可以在一卡通实施的范围内进行各类授权操作，如门禁、考勤、消费、巡更、停车、电梯控制、图书、医疗保健等。
1.操作员管理主要是对系统操作员的使用权限进行管理，指定一卡通系统各功能选项分别由相关人员进行操作管理。
2.人事管理
  人事信息管理主要是对系统人员资料录入、更改、删除，包括单位、部门、人员、职务、类别等信息。
3.卡片 管理
  卡片管理主要对卡片的发行、挂失、退卡及类型进行管理。
  （1）卡片发行  卡片发行包括长期卡、临时卡，由发卡、挂失、退卡、换卡、卡片激活、密码修改、权限等功能模块组成。
  ①发卡。发卡模块包含内部卡发行及临时卡发行两种操作。
  在内部卡发行时应选中某一持卡人，通过读写器读入卡号，并输入持卡人设定的密码，即完成发卡操作，该持卡人的所有权限自动被赋予该卡，发行卡片时，如该持卡人已有正常持卡记录，将不再发卡。
  临时卡发行时针对数据库某一特定记录，可无限制发行，发卡完毕，由推广使用部门管理，如停车场进出口处。以上IC卡含有抵押金，在发卡时自动将抵押金在持卡人充值记录中扣除。
  ② 挂失。当卡片不慎丢失时，可申请挂失，挂失时须同时输入持卡人密码，临时卡不做挂失处理。
  当卡片挂失，持卡人可选择是否补发新卡，新卡发行，原挂失卡中所有余款自动转入新卡账户，同时扣除被挂失卡押金。
  ③退卡。在持卡人不被授权于一卡通网络内活动时，应通知该持卡人办理退卡手续。
  当卡片挂失，持卡人必须退卡但手中无卡的情况下，其个人账户将被扣除本卡押金。退卡后持卡人可到财务室进行结算。
  IC卡因非人为损坏造成失效，应为持卡人免费办理换卡手续，即旧卡收回输入新卡信息。
  凡人为损坏，进行退卡操作，再补发新卡。
  ④密码修改。持卡人不慎忘记密码，可凭个人证件在发卡中心更改密码。
  ⑤授权。授权是一卡通系统的一个发卡中心的具体体现，在发卡中心可直接对一卡通系统中各子系统的任何设备分别授权。
（2）类型管理  类型管理包括卡片押金、卡片充值、批量充值、充值报表。
  ①卡片押金。实际应用中，要对不同类型的卡片收取不同的押金，如长期卡、临时卡、管理卡等。
  ②卡片充值。用于一次对一个人员的充值。
  ③批量充值。用于一次对多个人员的充值。
  ④充值报表。用于查询和打印充值数据信息。